Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TWF1Q12792 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms