Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms