Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TMPOP42166 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TMPOP42166 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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