Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRHP20396 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRHP20396 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRHP20396 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC006299.1-203ENST00000499625 2029 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 SORCS1-203ENST00000369698 2638 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRHP20396 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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