Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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