Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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USP18Q9UMW8 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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USP18Q9UMW8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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USP18Q9UMW8 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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