Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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