Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms