Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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