Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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