Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TAF1AQ15573 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms