Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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