Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SHBQ15464 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SHBQ15464 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SHBQ15464 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms