Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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