Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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