Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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