Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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