Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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