Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TRAF1Q13077 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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