Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms