Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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