Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCCD1P59942 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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