Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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