Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRGP23470 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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