Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RFXAPO00287 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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