Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB23Q9ULC3 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms