Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms