Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FSCN1Q16658 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms