Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USF2Q15853 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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