Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms