Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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