Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms