Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CUL1Q13616 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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