Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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