Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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TCOF1Q13428 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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TCOF1Q13428 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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TCOF1Q13428 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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