Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms