Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms