Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTPAP49638 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTPAP49638 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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