Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RIMKLBP1-201ENST00000408914 1164 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC008063.1-201ENST00000418335 640 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RPSAP23-201ENST00000446095 883 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LINC01501-203ENST00000449990 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SL253P-201ENST00000476759 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC116456.1-202ENST00000528151 597 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC084125.3-201ENST00000529377 398 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AP002840.1-201ENST00000546284 524 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MIR3150B-201ENST00000580142 86 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF827-208ENST00000513320 3165 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 APPL2-202ENST00000539978 2680 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SYT11-201ENST00000368324 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 PDILT-201ENST00000302451 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SERPINB11-201ENST00000382749 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PLA2G4E-201ENST00000399518 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MRAS-201ENST00000289104 4538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 THBS3-203ENST00000457183 2727 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CCDC174-206ENST00000611584 2720 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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