Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCN2BO60939 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCN2BO60939 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SCN2BO60939 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCN2BO60939 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCN2BO60939 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCN2BO60939 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms