Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms