Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAF8Q9UPN6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms