Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms