Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9Q9P2J2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms