Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCHIP1Q9P0W5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms