Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms