Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDP1Q9NUW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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