Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms