Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms