Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms